רפואה נתמכת ראיות

Relationship between Clinic and Ambulatory Blood-Pressure Measurements and Mortality התוסף של המאמר   יש שתי סיבות עקריות להשתמש ברגרסיית קוקס ולא בעקומות קפלן מאייר. אחת- כאשר המשתנה המסביר הוא כמותי (ולא קטגוריאלי עם שתי קבוצות בלבד). השנייה, חשובה יותר, היא כיוון שכך ניתן לקחת בחשבון מאפיינים נוספים מרובים של המטופלים, ולנטרל ערפלנים. Cox regression Multivariate analysis Adjustment for confound...

Relationship between Clinic and Ambulatory Blood-Pressure Measurements and Mortality התוסף של המאמר בפרק הזה נבין את משמעות ה hazard ratio (HR) בתוצאות מחקר. עבור משתנה כמותי , HR מציין פי כמה הקצב של האירועים גדל עבור כל יחידת מדידה של המשתנה. עבור משתנה קטגוריאלי, נבחרת קבוצת התייחסות, וה HR  מציין פי כמה קצב האירועים גדל כאשר המשתתף שייך לקבוצה אחרת. כאשר ה HR גדול מ 1, מדובר בעליה בסיכון לאירו...

טעות בהעלאת הפרק האחרון: ההקלטה שהועלתה השבוע לפרק "ההסבר הפשוט על רגרסיית קוקס" הייתה שגויה, וכעת העניין תוקן וההקלטה הנכונה הועלתה. מעכשיו באתר הפודקאסט ebm.podneam.com ועוד כמה ימים בכל אפליקציות הפודקאסטים, תוכלו לשמוע את הפרק האמיתי. תודה רבה לאביהוא על ההערה ובכלל לכל המאזינים ששלחו לי הערות, רעיונות ובקשות. לפודקאסט יש דף פייסבוק: "רפואה נתמכת ראיות- הפודקאסט" ואפשר לשלוח לי דרכו הערות מחשב...

Relationship between Clinic and Ambulatory Blood-Pressure Measurements and Mortality  התוסף של המאמר   רגרסיית קוקס היא מודל שמשתמש במונח ההאזארד, ומכפיל אותו ב hazard ratio מסוים עבור כל משתנה, כדי לקבל האזארד חדש. הנחת היסוד של המודל הזה, היא שהיחס בין שני האזארדים (ה hazard ratio) עבור כל משתנה נשאר דומה לאורך תקופת המעקב. המודל מאפשר לנו להעריך את אותו יחס, זאת אומרת פי כמה קצב האירועים (ההאזא...

Early Palliative Care for Patients with Metastatic Non–Small-Cell Lung Cancer Initial Invasive or Conservative Strategy for Stable Coronary Disease   עקומת קפלן מאייר היא אומדן. אומדן של עקומת השרידות אותה היינו רואים לו היו לנו נתונים עבור כל התקופה לכל משתתפי המחקר. בציר האופקי נמצא הזמן מתחילת המעקב, או מהרנדומיזציה, ובציר האנכי אומדן אחוז השרידות (או שיעור ההארעות המצטבר). אם נרצה לבדוק מהו אח...

Initial Invasive or Conservative Strategy for Stable Coronary Disease עקומת קפלן מאייר היא אומדן לעקומת שרידות או לעקומת אירועים מצטברים, וההסתכלות עליה דומה מאוד. אך בכל נקודת זמן היא מחושבת ומשורטטת לפי המשתתפים במחקר שזמינים לחוקרים. כיוון שבמחקר יש גיוס הדרגתי של משתתפים, חלק מהמשתתפים, אלו שגויסו מוקדם, יהיו עם זמן מעקב ארוך, אך חלק אחר, הקבוצה שגויסה מאוחר, ישתתפו במחקר רק זמן קצר ולכן יתרמו...

Relationship between Clinic and Ambulatory Blood-Pressure Measurements and Mortality התוסף של המאמר Initial Invasive or Conservative Strategy for Stable Coronary Disease   האזארד הוא הסיכוי לאירוע ביחידת הזמן הקרובה, בתנאי שהמשתתף במחקר כבר הגיע לנקודת זמן זו ללא אירוע עד כה. במלים פשוטות מדובר בקצב האירועים הצפוי ביחידת זמן, אך חשוב להבין שמדובר בחישוב מותנה: רק עבור אלו שהגיעו לתחילת יחידת זמן ז...

Relationship between Clinic and Ambulatory Blood-Pressure Measurements and Mortality התוסף של המאמר   במחקרים בהם עוקבים אחר אנשים לאורך זמן ובודקים מתי התרחש אירוע מסויים, למשל תמותה, אפשר לשרטט את גרף האירועים המצטברים לאורך זמן, זאת אומרת איזה אחוז מהקבוצה המקורית עבר כבר אירוע בנקודת זמן כלשהי. בכל נקודת זמן, יש גם את קבוצת האנשים שלא עברו אירוע, ואלו נקראים "השורדים". נאמר שהאירוע בו מדובר הו...

Predicting Mortality in Patients with Diabetes Starting Dialysis מהי משמעות הקבוע והמקדמים המתקבלים ברגרסיה לוגיסטית ואיך לתרגם את המקדמים ליחסי הסיכויים יחסי הסיכויים - odds ratio  

ישנה דרך אחרת לבטא את נוסחת הרגרסיה הלוגיסטית שהכרנו בפרק הקודם. במקום להשתמש בחזקה שבה מספר אוילר  הוא הבסיס, והתוצאה היא האודס, מבצעים לוג על שני הצדדים ומקבלים את הנוסחה הזו: Log odds=R כאשר "R" היא נוסחת הרגרסיה הלינארית המוכרת והלוג הוא על בסיס e. כך שאם ברגרסיה הלינארית הצבנו את הקבוע והמקדמים בצורה שתתן לנו ערך, כאן מתקבל לנו ה log odds, ולכן logistic   logistic regression מספר אוילר-  e  

  Predicting Mortality in Patients with Diabetes Starting Dialysis איך בנויה נוסחת הרגרסיה הלוגיסטית? היא משתמשת באותה נוסחה לינארית שהכרנו, אך התוצאה שלה צריכה לייצג סבירות. את זה הנוסחה עושה בעזרת שימוש בשני טריקים מתמטיים. הראשון הופך את התוצאה לכזו שתמיד תהיה חיובית- הכנסת הנוסחה כמעריך של חזקה. השני מאפשר להשתמש בתוצאה גם כשהיא גדולה מאחד: התוצאה מתקבלת בצורת odds במקום כ risk. Logistic regre...

West Nile Virus Disease: A Descriptive Study of 228 Patients Hospitalized in a 4-County Region of Colorado in 2003  ברגרסיה לוגיסטית הערך החזוי אינו מספר אלא סיכוי. למשל, באנשים עם מעורבות מוחית של קדחת הנילוס המערבי, מה הסיכוי לתמותה. כמו ברגרסיה לינארית, מדובר במצבים בהם אנחנו רוצים לבחון כמה משתנים מסבירים בבת אחת כדי לחזות משתנה (חזוי) אחד. אך כאן המשתנה החזוי הוא קטגוריאלי. למשל, נפטר או לא נ...

The Mortality of Doctors in Relation to Their Smoking Habits   כדי להבין רגרסיה לוגיסטית נצטרך להבהיר שני מושגים. Odds המונח "אודס" הוא דרך לבטא סיכון או סיכוי לאירוע מסוים. בכך הוא דומה מאוד לסיכון ("ריסק"). הוא מציין חלוקת שני מספרים: אלו עם האירוע חלקי אלו ללא האירוע, לדוגמה מספר האנשים שנפטרו חלקי מספר האנשים שלא נפטרו. בניגוד לסיכון, "ריסק", שיכול לקבל רק ערכים קטנים מ 1, אודס יכול להיות כל מ...

Associations of Amyloid Burden, White Matter Hyperintensities, and Hippocampal Volume With Cognitive Trajectories in the 90+ Study   רגרסיה לינארית מצריכה קשר לינארי בין המשתנה המסביר למשתנה החזוי. מה קורה כאשר לא זה המצב? ניתן לבצע טרנספורמציה (ביטוי מחדש) לאחד המשתנים, כפי שהסברנו ב פרק "ביטוי מחדש" ואז להכניס את המשתנה (לאחר הביטוי מחדש שלו) לנוסחת הרגרסיה. לכן לעתים כאשר נקרא מאמר שהשתמש ברגרס...

Prediction Factors in the Determination of Final Height in Subjects Born Small for Gestational Age רגרסיה לינארית מנסה לחזות עבור משתתפי המחקר מהו ערך המשתנה החזוי אצלם, בעזרת המשתנים המסבירים. עד כמה היא עושה את זה טוב? מדד פשוט הוא היחס בין השונות של המשתנה החזוי המוסברת על ידי נוסחת הרגרסיה, חלקי השונות הכללית של אותו משתנה חזוי. זהו ערך ה R בריבוע.   R squared Total variation Variation explain...

Prediction Factors in the Determination of Final Height in Subjects Born Small for Gestational Age ברגרסיה לינארית מרובה, תוצאת המחקר היא נוסחת רגרסיה עם מקדמים. אותם מקדמים הם הדבר שמעניין אותנו, כיוון שהם יראו לנו מהי השפעת משתנה מסוים, כששאר המשתנים נשארים קבועים. כאשר מדברים על תיקון (adjustment) למשתנים נוספים או שליטה (control) עליהם, הכוונה היא חישוב מקדם הרגרסיה של המשתנה שמעניין אותנו כאש...

 ברגרסיה לינארית מרובה יש יותר ממשתנה מסביר אחד, ולעתים קרובות משתנים מסבירים מרובים. כל משתנה מסביר מקבל מקדם משלו בנוסחת הרגרסיה, ואותו מקדם מייצג את השפעת אותו משתנה על המשתנה המוסבר, לו היינו שולטים על כל שאר המשתנים האחרים ("מנטרלים" אותם). מבחינת תיאור גרפי, המעבר מרגרסיה לינארית פשוטה לרגרסיה עם שני משתנים מסבירים דורש מעבר מקו על דף למרחב תלת ממדי, והמעבר לרגרסיה עם יותר משני משתנים מסבירי...

Effects of Exposure to Road, Railway, Airport and Recreational Noise on Blood Pressure and Hypertension קו הרגרסיה הלינארית הוא קו ישר שמייצג "דרך אמצע" ולא ייצוג מדוייק של קשר בין שני משתנים, אלא רק תיאור מקורב של הקשר הלינארי ביניהם. עבור משתתף בודד במחקר, הערך של המשתנה המוסבר לא ייפול בדיוק על קו הרגרסיה, כיוון שמלבד המשתנה המסביר ישנם תמיד עוד גורמים מסבירים וגם מרכיב של אקראיות. במלים אחרות,...

Effects of Exposure to Road, Railway, Airport and Recreational Noise on Blood Pressure and Hypertension משוואת קו ישר מייצגת קשר בין שני משתנים. הקשר הזה מבוטא בעזרת מקדם (המספר בו מוכפל המשתנה הראשון) ועוד קבוע. ברגרסיה לינארית, המקדם נקרה "בטא". הערך של המקדם הזה תלוי גם בעצמה של הקשר בין שני המשתנים וגם בקנה המידה שבו מדדו את המשתנים עצמם. Y=mX+n ובצורה המקובלת לכתיבה ברגרסיה לינארית Y=beta(X)+...

בפרקים הקודמים דברנו גם על תפקידי הרגרסיה וגם על נוסחת הרגרסיה. בפרק זה ננסה לחבר בין שניהם ולהבין איך נוסחת רגרסיה עוזרת להבין השפעה של מאפיין מסוים של מטופל, בעזרת המקדם שאותו מאפיין מקבל בנוסחה, איך היא עוזרת לנטרל ערפלנים, כאשר מכניסים לנוסחה משתנה שהוא ערפלן, ואיך היא יכולה לעזור לחיזוי עבור מטופל מחוץ למחקר. Regression formula/equation- נוסחת הרגרסיה Confounder- ערפלן Prediction- חיזוי  

בחיים הרגילים, המח שלנו מבצע משהו קצת דומה לרגרסיות, בפעולה של חישובים ותחזיות. הוא מתחשב במשתנים שונים, שכל אחד מהם מקבל חשיבות שונה. למשל, יכול להיות שהמשתנה "כמות האננסים" יקבל חשיבות שונה מ"כמות המלפפונים" כאשר אנחנו חוזים את התשלום הסופי בקופה אצל הירקן. המח מעריך את החשיבות (מקדם) של כל אחד מהמשתנים, ומבצע תחזית של הסכום הסופי. זו פעולה מוחית שדומה לרגרסיה לינארית. אפשר לחשוב על פעולה מוחית...

(וגם: מפת דרכים לפרקים הבאים) בנוסחאות הרגרסיה מאפיינים שונים של המשתתפים במחקר מקבלים חשיבות שונה. המאפיינים נקראים "משתנים", והחשיבות נקראת "מקדם". הרעיון המרכזי בנוסחה הוא שערך של משתנה מוכפל במקדם שלו, למשל, המשקל בק"ג מוכפל במקדם מסויים, וכאשר מבצעים את זה עבור כמה משתנים ואז מסכמים את התוצאות מקבלים מספר שהוא בסיס לחיזוי. עם המספר הזה אפשר לעשות כל מיני דברים שנציג בפרקים הבאים- למשל להוסיף...

Trajectories of Adolescent Media Use and Their Associations With Psychotic Experiences   רגרסיה מרובת משתנים היא טכניקה שבא לוקחים בחשבון מאפיינים שונים של המטופל כדי לבצע תחזית לגבי מאפיין אחר או תוצא. מלבד אפשרות לבצע תחזית רגרסיות מאפשרות לנו לנטרל ערפלנים כדי לבדוק האם מאפיין מסוים משפיע על התוצא, וגם לכמת את השפעת המאפיין על התוצא. יש שלוש סוגי רגרסיות נפוצות במחקרים רפואיים: רגרסיה לוגיסטית,...

Serum Immunoreactive-Leptin Concentrations in Normal-Weight and Obese Humans   ביצוע מתאם פירסון עליו דברנו בפרק הקודם מתאים כאשר מתקיימות כמה הנחות, ביניהן קשר ישר בין שני המשתנים, משתנים כמותיים והתפלגות קרובה להתפלגות נורמלית של כל אחד משני המשתנים . כאשר יש קשר שאינו ישר, כשהמשתנים לא מתפלגים נורמלית, או כשמדובר במשתנה אורדינלי אחד לפחות, צריך להשתמש במתאם ספירמן. זוהי המקבילה הא-פרמטרית של מת...

Antiepileptic Drug Exposure in Infants of Breastfeeding Mothers With Epilepsy    חישוב מקדם המתאם של פירסון מבוצע בעזרת זוגות רבים של נתונים. (למשל, שני מאפיינים כמותיים של משתתף אחד במחקר, או ריכוז תרופה אצל אם ואצל התינוק שלה). זוגות הנתונים ממורכזים סביב נקודת האפס, ועוברים סטנדרטיזציה (תקנון). לאחר שתי הפעולות האלו, עבור כל זוג נתונים  ערך של משתנה אחד מוכפל בערך של המשתנה השני. ככל שהקשר בין...