腸内細菌相談室

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、うつ病の合併症として糖尿病、不安障害、心疾患をご紹介します。 ・厚生労働省e-ヘルスネット:糖尿病とこころ:https://www.e-healthnet.mhlw.go.jp/information/heart/k-05-006.html ・アメリカ疾病予防管理センター: Mental Health Conditions: Depression and Anxiety: https://www.cdc.gov/tobacco/campaign/tips/diseases/depression-anxiety.html ・ The Johns Hopkins...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 「うつ病を知ろう」シリーズ、第4回のテーマはうつ病のメカニズムについて、一緒に勉強していきます。モノアミン仮説や分子・細胞仮説など、様々なメカニズムが提唱されています。 ・一般社団法人日本うつ病センター：こころと脳の関係：https://www.jcptd.jp/contents/contents/detail/50?categoryId=30 ・一般社団法人日本うつ病センター：抗うつ薬のメカニズム：https://www.jcptd.jp/contents/...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、うつ病の原因について、一緒に考えていきます。 ・厚生労働省：こころの耳：https://kokoro.mhlw.go.jp/about-depression/ad002/ ・Nature reviews disease primers: 大うつ病性障害: https://www.natureasia.com/ja-jp/reviews/highlight/78882 ・NHC: Causes - Clinical depression: https://www.nhs.uk/mental-health/conditions/clinical-depression/causes/ ・Chand SP...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、うつ病の位置づけや類型について、厚生労働省、東京都福祉保健局、Nature、アメリカ精神医学会の資料を参考にお話していきます。 ・東京都保健福祉局(精神障害)：https://www.fukushihoken.metro.tokyo.lg.jp/tokyoheart/shougai/seishin.html ・厚生労働省(精神障害（精神疾患）の特性（代表例）)：https://www.mhlw.go.jp/seisakunitsuite/bunya/koyou_roudou/koyou/shoug...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードより、新しいシリーズとして #うつ病を知ろう をテーマに、腸内細菌とうつ病を関係を深掘りしていきます。前半は、うつ病とは何かについて一緒に勉強していきます。まずは、うつ病の統計から。 厚生労働省の資料：https://www.mhlw.go.jp/stf/wp/hakusyo/kousei/18/backdata/01-01-02-09.html OECDの資料: https://www.oecd-ilibrary.org/sites/f9c64182-en/index.html?itemId=/co...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、腸管免疫と腸内細菌叢の関係が崩れることを示したNature cell biologyの研究をご紹介します！ 原著論文：https://www.nature.com/articles/s41556-023-0115-5 プレスリリース:http://www.biken.osaka-u.ac.jp/achievement/research/2023/194 長寿者の腸内細菌についてのエピソード：#13 "100歳以上の長寿者に共通する腸内細菌とその性質とは？": https://open.spo...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、PacBio社の革新的な技術により生み出されたHiFiリードについてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、クラウドファンディングに挑戦しています。「腸内細...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、プロバイオティクスの一種であるLactobacillus plantarumが酵素のサブユニットを介して宿主の結合組織に結合するというお話をします！ 参考文献：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jobm.201600575 ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、喫煙により腸内細菌叢が変化し、大腸がんのリスク増加に関係することを示した研究をご紹介します！ 参考文献：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9664112/ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、202...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードは、6月の科学系ポッドキャストに向けたテーマの紹介と参加番組の募集案内です！ そして、一度やってみたかった投票機能を設定してみました。投票、お待ちしております！ ps.投票機能、1種類しか設定できないみたいですね。皆さんに観察について聴きたかったです... ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクス...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、腸内環境における適応進化についてお話しました！ 実は、生涯を通して腸内細菌は少しずつ進化しています。 参考文献：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31028005/ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、ここ半年で盛り上がりを見せている細菌製剤の業界についてお話しました！ AnswersNews様の参考記事：https://answers.ten-navi.com/pharmanews/25214/ ご快諾ありがとうございました！ フェリング・ファーマの細菌製剤、Rebyota®のエピソード：https://open.spotify.com/episode/2nnLvTHHfALzlZonvPGM1c?si=PAedg8xWRHKPRhEHM8u6bw ================================= 提供...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、種同定の基礎の締めくくりとして、シーケンシングによる種同定の限界点についてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、クラウドファンディングに挑戦して...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、ショットガンメタゲノムシーケンシングによる腸内細菌叢の種同定についてお話しました。 16S rRNA遺伝子アンプリコンシーケンシングとの比較も含めてお話していきます！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、20...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、腸内細菌叢の具体的な解析手法として、16S rRNA遺伝子アンプリコンシーケンシングによる腸内細菌叢の解析についてお話します！ 紹介した解析パイプラインの順序は、バイオインフォマティクスの教科書に記載されています：https://www.kspub.co.jp/book/detail/5138212.html ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピ...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、今日の腸内細菌研究には欠かせないデータベースについてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、クラウドファンディングに挑戦しています。「腸内細菌ドナ...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、塩基配列を用いた種同定で欠かせない相同性検索について、大まかな流れとBLASTについてお話しました！ 国立遺伝学研究所, 相同性検索プログラムBLASTの内部構造: https://www.ddbj.nig.ac.jp/activities/blast-doc.html 奈良先端大, ペアワイズアライメントと配列相同性解析配列相同性解析: http://isw3.naist.jp/IS/Kawabata-lab/LECDOC_KINDAI/2010/alignment_10Apr20_pri...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、細菌の種分類と塩基配列の関係として、DNA-DNAハイブリダイゼーション、16S rRNA遺伝子、マーカー遺伝子、ANIの観点からお話しました！今日の内容はちょいムズです！ ANI vs DDHの関係論文①： https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.0409727102#body-ref-ref25 ANI vs DDHの関係論文②：https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijs.0.644...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今週より、種同定の基礎と題して、腸内細菌の種を決定する方法についてお話します。まずは、種とは何かから一緒に考えてみましょう。 Oxford: Leaner's Dictionaries: https://www.oxfordlearnersdictionaries.com/definition/english/species 筑波大学八畑先生教員紹介の記事：https://cbs.biol.tsukuba.ac.jp/update/398 ================================= 提供：メタジェンセラピューティ...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、配列決定後のクオリティコントロールについてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、クラウドファンディングに挑戦しています。「腸内細菌ドナー」や「腸...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、配列決定の技術として各社が提供するシーケンシング技術について概観しました。 ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、クラウドファンディングに挑戦しています。「腸内...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、蛍光と配列決定についてお話しました！蛍光とは何かからお話していきます！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、クラウドファンディングに挑戦しています。「腸内細菌...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、配列決定の基礎であるPCRの原理についてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、クラウドファンディングに挑戦しています。「腸内細菌ドナー」や「腸内細...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 毎月10日は科学系ポッドキャストの日！今月のテーマは「論文」ということで、腸内細菌相談室では「論文の構造と目的別読み方」についてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、ク...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、セントラル・ドグマや遺伝のお話を通して、「塩基配列が生物の個性を決める。」というお話をしました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、クラウドファンディングに...