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这项研究开发了一种基于FGF4诱导的人脑桥类器官模型，用于精准模拟具有H3.3K27M突变的弥漫性中线胶质瘤（DMG）。研究证实，特定的脑桥胶质细胞发育环境是肿瘤发生的关键，该模型成功复制了患者肿瘤的浸润性生长与转录组异质性。通过在模型中测试GD2 CAR T细胞疗法，科学家发现了治疗过程中的功能性衰竭现象，并识别出一群高效但寿命较短的效应细胞。此外，研究通过引入小胶质细胞构建了更复杂的肿瘤微环境，揭示了免疫抑制如何削弱...

这项研究深入探讨了胶质母细胞瘤（GBM）与脑转移瘤中鲜为人知的肿瘤微生物组特征。研究人员利用成像、培养及测序等多种技术，证实了脑肿瘤内部存在细胞内活性细菌。实验发现，脑转移瘤的微生物丰富度与多样性显著高于GBM，且不同肿瘤类型具有独特的微生物组成与代谢通路。此外，细菌特征呈现出显著的空间差异，大脑后部区域的肿瘤比前部具有更高的微生物多样性。研究还指出，特定的细菌富集（如副球菌属）与脑转移瘤患者较短的生存...

这项研究开发了一种名为JX1.1的高亲和力抗体偶联药物 (ADC)，专门用于治疗表达TRBC2的T细胞癌症。由于正常T细胞群由TRBC1和TRBC2两种亚型组成，而T细胞恶性肿瘤通常只克隆性地表达其中一种，因此这种靶向策略能够在消灭癌细胞的同时，保留约 40% 的健康T细胞以维持免疫功能。研究人员通过噬菌体展示技术优化了抗体序列，使其对TRBC2具有极高的识别精度且不与TRBC1结合。实验证明，该ADC能被癌细胞迅速内吞并释放毒性载荷，在细胞实...

这项研究揭示了染色质重塑因子 SMARCA5 在区分胰腺癌变与组织再生中的核心作用。研究发现，SMARCA5 特异性地维持了由突变 KRAS 驱动的恶性染色质开放状态，而对正常的组织修复过程没有影响。通过剔除 SMARCA5，研究人员能够成功阻断小鼠体内胰腺癌的发生，并使受损组织回归正常的再生路径。这种特异性调控是由转录因子 RUNX1 在时间与空间上的精准控制实现的，该因子仅在持续的 MAPK 信号诱导下积累并招募 SMARCA5 到恶性基因位点...

这项研究利用单细胞多组学技术构建了儿童造血发育图谱，旨在揭示T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）产生耐药性和复发的生物学机制。研究人员发现了一种特殊的类骨髓祖细胞（BMP-like）亚群，该细胞群与化疗耐药、微小残留病（MRD）阳性及极低的存活率密切相关。通过对40个病例的深入分析，研究证实了NOTCH1突变能驱动癌细胞脱离这种高危的原始状态，而缺乏此类突变的细胞则表现出更强的干性。此外，该多组学特征能够跨亚型预测患者...

这项研究介绍了一种名为 SMMILe 的计算病理学新方法，旨在解决数字化切片分析中空间量化准确性不足的问题。研究人员指出，传统的多实例学习（MIL）模型虽然能有效预测整张切片的标签，但往往会丢失关键的空间解剖细节。SMMILe 通过引入超像素（Superpatch）机制和马尔可夫随机场（MRF）优化，实现了在不牺牲分类精度的前提下，对组织微环境进行精准定位。该系统在涵盖六种癌症类型的八个数据集上进行了验证，其表现显著优于现有的...

这项研究通过构建多组学细胞与空间图谱，深入探讨了 TP53 基因突变如何重塑肺腺癌的肿瘤微环境。研究发现，携带突变基因的癌细胞不仅失去了正常的肺泡特征，还表现出高度的细胞可塑性以及与恶性进展相关的基因活跃度。在突变肿瘤中，研究人员识别出由特定巨噬细胞和成纤维细胞构成的多细胞生态位，这与肿瘤的缺氧和转移倾向密切相关。此外，TP53 突变还导致肿瘤内血管成分减少，并富集了多种免疫检查点相互作用。这些发现不仅揭示...

这项研究通过结合激光捕获显微切割与单核转录组测序技术，详细绘制了人类胎儿小脑在发育过程中的分子与细胞图谱。研究人员分析了从受孕后9到21周的样本，识别出21种不同的细胞类型，并重点揭示了人类特有的菱唇（Rhombic Lip）祖细胞生态位及其演化路径。通过对比小脑空间区域与单细胞数据，该研究构建了一个全面的发育细胞图谱，填补了以往数据库中对人类早期小脑研究的空白。此外，研究还通过对比人类与小鼠的转录组差异，确定了...

这项发表在《Nature Cancer》的研究通过构建名为 TabulaTIME 的泛癌症单细胞图谱，对 36 种癌症类型的 肿瘤微环境 进行了深度解析。研究人员整合了来自 746 名患者的约 450 万个细胞，识别出 56 种细胞亚型，并重点发现了一种以 CTHRC1 为标记的促纤维化癌症相关成纤维细胞（CAF）。这种 CTHRC1+ 成纤维细胞 主要聚集在恶性组织与正常组织的交界处，可能起到了阻碍 免疫细胞浸润 的屏障作用。此外，研究还揭示了 SLPI+ 巨噬细胞 与...

这项发表在《Nature Cancer》的研究介绍了名为SWIFT-seq的单细胞测序工作流，旨在为多发性骨髓瘤及其癌前病变提供一种非侵入性的检测手段。通过对101名受试者的血液和骨髓进行配对分析，研究者证明了利用循环肿瘤细胞（CTCs）进行单细胞转录组和B细胞受体测序的可行性。该技术不仅能精准计数血液中的肿瘤细胞，还能在仅有10个细胞的情况下准确推断细胞遗传学异常。此外，研究揭示了循环肿瘤细胞能完整反映骨髓病灶的克隆演化动态和...

这项研究揭示了癌细胞通过细长的隧道纳米管（TNTs）向成纤维细胞传递线粒体的生物学机制。这种线粒体转移会诱导成纤维细胞发生代谢改变，并使其分化为癌相关成纤维细胞（CAFs）。研究指出，该过程关键取决于线粒体运输蛋白 MIRO2，下调该蛋白可有效抑制线粒体交换及肿瘤生长。分化后的成纤维细胞会释放促进肿瘤发展的分泌组和基质组，从而在临床前模型中加速癌症进展。临床观察进一步证实，MIRO2 在皮肤癌边缘高度表达，显示了该机...

这项研究揭示了前列腺基底细胞在Pten基因缺失后转化为肿瘤的分子机制。研究发现，这种细胞的可塑性和重编程过程具有明显的区域差异性，其中前叶和背侧前列腺的基底细胞更易通过一种中间状态演变为浸润性腺癌。实验进一步表明，该重编程过程与先天免疫通路及NF-κB信号的激活密切相关。通过联合使用Pik3ca突变或p53缺失，科研人员观察到基底细胞向管腔细胞转化的速度显著加快。最后，研究证实利用药物抑制mTOR、JAK-STAT或NF-κB通路...

这项研究指出，骨骼肌内皮功能障碍是导致癌症恶病质（肌肉萎缩）的核心驱动因素。研究人员通过多种肿瘤模型发现，肌肉血管密度的降低实际上发生在肌肉萎缩之前，这一现象在癌症患者身上也得到了验证。研究揭示了肿瘤释放的激活素 A（Activin A）会抑制肌肉血管内皮中的 PGC1α 表达，进而引发血管渗漏和功能衰竭。实验证明，修复内皮细胞中的 PGC1α 活性能够有效维持血管密度并减缓肌肉流失。因此，针对改善血管内皮功能而非仅仅针...

这项研究揭示了胶质母细胞瘤（GBM）如何通过与小胶质细胞及巨噬细胞（TAM）的相互作用，实现从团块生长向浸润性生长的转变。研究发现，小胶质细胞在肿瘤扩散前便已在肿瘤场中被激活，并逐步演变为围绕浸润灶的“神经胶质网”，最终形成引导肿瘤细胞集体迁徙的“肿瘤流”（oncostreams）。通过单细胞测序技术，科学家识别出了对应不同入侵生态位的特定基因特征，并证实了Plexin-B2受体在重构细胞外基质及对齐入侵路径中的核心作用。实验...

这项研究利用单细胞RNA测序与物理相互作用细胞测序技术，系统分析了乳腺癌发展过程中中性粒细胞的异质性及其功能。研究发现，这些免疫细胞在癌症晚期会与肿瘤细胞发生直接物理接触，并由肿瘤相关巨噬细胞招募至肿瘤微环境中。这种物理相互作用不仅激活了促进肿瘤增殖和血管生成的特定基因程序，还形成了一个支持癌症侵袭的信号微环境。此外，研究确定了一种与患者生存率降低显著相关的促癌分子特征，为乳腺癌的临床治疗提供了新的...

这项研究通过单细胞测序技术揭示了IDH突变型胶质瘤从低级别向高级别演变的生物学机制。研究发现，此类肿瘤最初由类似少突胶质前体细胞（OPC）的低增殖细胞驱动，其恶性特征主要依赖DNA高甲基化等表观遗传手段来激活癌基因并抑制免疫反应。随着病情进展，肿瘤细胞通过表观遗传重塑转向高增殖的神经前体细胞（NPC）状态。在此过程中，由于细胞快速分裂导致甲基化丢失，肿瘤转而依靠基因组拷贝数变异（如CDKN2A缺失）来维持生长。这一...

这项发表在《Nature Cancer》的研究通过单细胞转录组测序技术，深入解析了嗅神经母细胞瘤（ONB）的细胞图谱。研究者不仅揭示了肿瘤内部的高度异质性，还突破性地提出了由神经型、基底型和间质型组成的三分类系统。通过对比正常嗅上皮细胞，研究确立了不同肿瘤亚型的细胞起源，并发现了与恶性转化相关的关键分子特征。此外，该研究识别出的特定生物标志物可用于临床预后评估，并为精准化疗和免疫治疗提供了新的策略建议。 Reference...

这项研究通过空间蛋白质组学和单细胞成像技术，揭示了肝细胞癌（HCC）在治疗后产生微小残留病灶（MRD）并导致复发的免疫逃逸机制。研究人员发现，残留肿瘤组织中富集了PD-L1+ M2型巨噬细胞，这些细胞通过TGFβ1通路与干细胞样癌细胞发生空间相互作用，从而诱导CD8+ T细胞耗竭。通过人类样本分析与多种小鼠模型验证，研究证实这种特定的空间微环境是肿瘤持久存在的关键。实验结果表明，联合阻断PD-L1和TGFβ可以有效清除残留的癌细胞...

这项研究建立了一个包含 1,294个血浆样本 的大规模泛癌无细胞DNA（cfDNA）数据库，涵盖了 11种主要癌症类型、Li-Fraumeni综合征及健康对照组。研究人员开发了 标准化的计算工作流，通过整合 甲基化谱（Methylomes） 与 片段组学特征（Fragmentomes），成功克服了跨队列研究中的技术偏倚。分析识别出 14,202个泛癌差异甲基化区域，并发现不同癌症在片段长度、末端基序及核小体印迹方面存在显著异质性。实验证明，结合这两类分子特征...

这份研究报告介绍了一种新型表观转錄组编辑筛选平台，旨在系统性识别癌症中具有功能意义的 m6A RNA 修饰位点。通过利用 dCasRx-METTL3 技术，研究人员在肺癌和前列腺癌模型中精准定位了 222 个影响细胞增殖的位点。研究重点揭示了 CHD9 基因上的 m6A 修饰在前列腺癌中发挥的关键抑癌作用。该位点的修饰通过 YTHDF1/3 阅读器增强了 CHD9 的蛋白翻译，进而维持 MYBBP1A 蛋白在核质中的定位，并激活 CDKN1A (p21) 信号通路。这项成果...

这项研究揭示了 CRTAM 分子在免疫检查点阻断治疗中作为特定免疫相关副作用（irAEs）控制点的关键作用。研究团队通过分析转录组和临床数据发现，抑制 CRTAM 能够有效减轻如肠炎和肺炎等免疫毒性症状，且不会削弱免疫治疗对肿瘤的打击力度。实验表明，CRTAM+ T细胞会利用 CADM1 受体优先浸润正常组织而非肿瘤，并诱导导致组织炎症的3型免疫反应。通过遗传敲除或药物阻断 CRTAM-CADM1 轴，科研人员成功实现了免疫治疗中“减毒不减效”的...

这项名为 GENEVA 的研究推出了一种具有单细胞分辨率的可扩展平台，旨在通过整合多种患者来源和癌症细胞系，模拟肿瘤的遗传多样性。该系统克服了传统异种移植模型难以规模化的限制，能够在单一实验中同时观察三维培养和活体模型对药物干预的反应。研究人员利用该平台深入分析了 KRAS-G12C 抑制剂的疗效，发现线粒体激活是诱导细胞死亡的关键机制。同时，研究通过对比体内外数据，识别出上皮-间质转化（EMT）是导致药物耐受的主要原...

这份研究通过分析TONIC临床试验中103名转移性三阴性乳腺癌患者的纵向样本，揭示了肿瘤微环境动态演变与免疫治疗效果的关系。研究团队利用高分辨率的多重成像技术和开源分析管道SpaceCat，从原发灶及治疗前后的转移灶中提取了超过800项空间特征。实验结果表明，治疗中采集的样本比初始样本具有更强的疗效预测能力，其多变量预测模型的准确率（AUC）高达0.90。肿瘤边缘的T细胞浸润、免疫细胞多样性以及骨髓细胞上的PDL1表达被确定为...

这份报告研究了名为 SC291 的新型通用型 CD19 CAR T 细胞在癌症和自身免疫病患者中的临床表现。该细胞经过低免疫（HIP）基因编辑，通过敲除 HLA 并过表达 CD47 来逃避人体的免疫排斥。临床数据显示，尽管患者会对未完全编辑的细胞产生攻击，但完全编辑的 HIP CAR T 细胞在所有患者中均能成功避开 T 细胞、NK 细胞及抗体的检测与杀伤。此外，研究发现患者体内若不产生针对 HLA 的特定抗体，可作为深层组织 B 细胞耗竭的有效监测指标...

这项研究通过建立包含 260 个胰腺癌类器官 的大型生物样本库，深入探讨了这种致命癌症的多组学特征与治疗反应之间的联系。研究团队利用自主开发的 HNetDig 算法 识别出了新的编码和非编码基因驱动因子，并揭示了蛋白质糖基化和胆固醇代谢是导致化疗耐药的关键机制。研究特别强调，他汀类药物（如阿托伐他汀）能够通过阻断上述代谢通路并抑制上皮-间质转化（EMT），显著提高耐药细胞对化疗的敏感性。一项包含 37 名晚期患者的 2 期...