Vivekanandan Ramalingam
Science Shutter Time
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Vivekanandan Ramalingam
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23. Apr 2026
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Understanding DNA Sequence Made Easy: A PyTorch Reimplementation of AlphaGenome 23.04.2026 1:00:52
How do DNA foundation models help us understand DNA at scale? In this video, I discuss how modern sequence-to-function DNA models can uncover biological meaning from genomic sequence with our guests Alejandro Buendia and Danila Bredikhin from Anshul Kundaje’s lab at Stanford. We also discuss their PyTorch reimplementation of the foundational DNA sequence-to-function model, AlphaGenome, that makes...
What Can Worms Teach Us in the Age of AI? 23.04.2026 59:18
In the age of AI and virtual cells, what do model organisms such as C. elegans still have to offer? In this video, I speak with Dr. David Sherwood, Professor and Associate Chair of Biology at Duke University, about why worms remain a powerful system for biological discovery. We discuss the unique advantages of C. elegans, including its rapid life cycle, transparency, genetic tractability, invarian...
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