腸内細菌相談室

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、腸内細菌叢の具体的な解析手法として、16S rRNA遺伝子アンプリコンシーケンシングによる腸内細菌叢の解析についてお話します！ 紹介した解析パイプラインの順序は、バイオインフォマティクスの教科書に記載されています：https://www.kspub.co.jp/book/detail/5138212.html ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピ...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、今日の腸内細菌研究には欠かせないデータベースについてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、クラウドファンディングに挑戦しています。「腸内細菌ドナ...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、塩基配列を用いた種同定で欠かせない相同性検索について、大まかな流れとBLASTについてお話しました！ 国立遺伝学研究所, 相同性検索プログラムBLASTの内部構造: https://www.ddbj.nig.ac.jp/activities/blast-doc.html 奈良先端大, ペアワイズアライメントと配列相同性解析配列相同性解析: http://isw3.naist.jp/IS/Kawabata-lab/LECDOC_KINDAI/2010/alignment_10Apr20_pri...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、細菌の種分類と塩基配列の関係として、DNA-DNAハイブリダイゼーション、16S rRNA遺伝子、マーカー遺伝子、ANIの観点からお話しました！今日の内容はちょいムズです！ ANI vs DDHの関係論文①： https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.0409727102#body-ref-ref25 ANI vs DDHの関係論文②：https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijs.0.644...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今週より、種同定の基礎と題して、腸内細菌の種を決定する方法についてお話します。まずは、種とは何かから一緒に考えてみましょう。 Oxford: Leaner's Dictionaries: https://www.oxfordlearnersdictionaries.com/definition/english/species 筑波大学八畑先生教員紹介の記事：https://cbs.biol.tsukuba.ac.jp/update/398 ================================= 提供：メタジェンセラピューティ...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、配列決定後のクオリティコントロールについてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、クラウドファンディングに挑戦しています。「腸内細菌ドナー」や「腸...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、配列決定の技術として各社が提供するシーケンシング技術について概観しました。 ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、クラウドファンディングに挑戦しています。「腸内...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、蛍光と配列決定についてお話しました！蛍光とは何かからお話していきます！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、クラウドファンディングに挑戦しています。「腸内細菌...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、配列決定の基礎であるPCRの原理についてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、クラウドファンディングに挑戦しています。「腸内細菌ドナー」や「腸内細...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 毎月10日は科学系ポッドキャストの日！今月のテーマは「論文」ということで、腸内細菌相談室では「論文の構造と目的別読み方」についてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、ク...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、セントラル・ドグマや遺伝のお話を通して、「塩基配列が生物の個性を決める。」というお話をしました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金) まで、クラウドファンディングに...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 突然ですが質問です。お腹の中の腸内細菌叢はどのようにして知ることが出来るのでしょうか？ この質問に答えるべく、今週は配列決定の基礎、来週は種同定の基礎と題してお話をしていきます。 今回のエピソードでは、塩基配列とは何かについてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードは、今週のテーマである糞便微生物移植のお話の締めくくりとして、糞便微生物移植により変化する腸内細菌叢を316例について解析したメタアナリシスの研究をご紹介します！ 原著論文：https://www.nature.com/articles/s41591-022-01913-0 ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さ...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードは、第250回記念！いつも聴いてくださっているリスナー、最近聴き始めたリスナーの方に向けてお話をしました！ これからも、一緒に腸内細菌、腸内環境について楽しく学んで行きましょう！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回は、糞便微生物移植用の便バンクを提供するアメリカの非営利団体、OpenBiomeの活動についてご紹介します。 OpenBiomeのメソッドを共有した論文：https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcimb.2021.622949/full ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回は、糞便微生物移植の手順として2013年に定められたアムステルダムプロトコルについてお話します！ アムステルダムプロトコルの論文：https://doi.org/10.1053/j.gastro.2013.08.058 ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回は、2022年11月30日に米国FDAの承認を受けたバイオ医薬品で、糞便微生物由来のRebyota®についてお話しました！ プレスリリース：https://d2gohj824v350l.cloudfront.net/wp-content/uploads/sites/32/2022/12/08211836/20221209_pressrelease.pdf Rebyota®の仕様：https://ferringus2.corporate-us.ferring.tech/wp-content/uploads/sites/12/2022/12/9009000002_REBYOTA-PI_11-2022.pdf =====...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回は、2023年1月より先進医療Bに承認された抗菌剤併用の糞便微生物移植についてお話します！保険適用に向けて糞便微生物移植の実施が国内でもスタート！潰瘍性大腸炎患者のリスナーに届け！ 先進医療承認、順天堂リリース：https://www.juntendo.ac.jp/news/00311.html 潰瘍性大腸炎患者、便ドナーの募集：https://hosp.juntendo.ac.jp/clinic/department/shokaki/about/gastrointestinal/intest...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今週は、最近話題の糞便微生物移植について、深堀していきます！ 今回のエピソードでは、糞便微生物移植の概要と、メリット、デメリットについてお話します！ アムステルダム大学の研究：https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/nejmoa1205037 FMTの有害事象に関するメタアナリシス：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8922263/ ================================= 提供：メタジェンセ...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、再発性のClostridioides difficile菌感染症に対して、クロロトニルAを投与することの有効性を調査した研究をご紹介します。 参考文献： The natural product chlorotonil A preserves colonization resistance and prevents relapsing Clostridioides difficile infection URL: https://www.cell.com/cell-host-microbe/fulltext/S1931-3128(23)00147-6#%20 ===============...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、１型糖尿病と口腔細菌叢、腸内細菌叢の関係を示した研究のご紹介をします。歯磨きは大事！ 参考文献： Kunath, B J et al. “Alterations of oral microbiota and impact on the gut microbiome in type 1 diabetes mellitus revealed by integrated multi-omic analyses.” Microbiome vol. 10,1 243. 28 Dec. 2022, doi:10.1186/s40168-022-01435-4. URL: https://microbiom...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回は、なななんと....!! 大先輩ポッドキャスターのコペテンナイトから、春名まことさんにお越しいただき、腸内細菌や腸内環境の世界の魅力を沢山お話しました！腸内細菌にまつわるクイズを3問用意しているので、リスナーの皆様も一緒にチャレンジしてみてくださいね！ 🪐コラボありがとうございました🌏 コペテンナイトの情報はこちら！ 科学の視点が、これまでのものの見方を変える。 コペテン...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードは、腸内細菌相談室では珍しいですが雑談回です。 腸内細菌相談室のリスナーはスゴくて、クラウドファンディングの進捗がスゴイというお話をしています。 ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、昨日2023/4/25にプレスリリースがあった、カルビー、メタジェン、サイキンソーが共同で開発したサービス、「Body Granola」についてご紹介します！食品の商品開発に、腸内細菌研究は新しい視点をもたらします！ ・PRTIMES: https://prtimes.jp/main/html/rd/p/000000038.000051373.html ・Body Granola: https://bodygranola.jp/shop/pages/about =========================...

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。 今回のエピソードでは、がんに対する免疫機能と免疫チェックポイントについてのお話です。今後、腸内細菌と免疫機能の関係をお話する上で、とっても重要な基礎となるお話です。 参考文献は、東京化学同人の免疫学の基礎(第5版)の19.がんと免疫です。 リンク：https://www.tkd-pbl.com/book/b614596.html ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社 メタジェン...